Prof. Dr. Mario Stanke

Professur für Bioinformatik

Kontakt

Prof. Dr. Mario Stanke

Institut für Mathematik und Informatik
Walther-Rathenau-Straße 47
17489 Greifswald

Büro: Felix-Hausdorff-Str. 8, Raum 0.63 (C_FunGene Gebäude)

Telefon +49 3834 420 4642
mario.stankeuni-greifswaldde 

Forschungsinteressen

Meine Hauptforschungsinteressen sind probabilistische Modelle und Methoden maschinellen Lernens für strukturierte biologische Daten und effiziente Algorithmen für Inferenz in diesen Modellen. Insbesondere entwickeln, trainieren und implementieren wird Rekurrente Neuronale Netze, bedingte Markow'sche Zufallsfelder, Hidden-Markow-Modelle für verschiedene konkrete Anwendungen wie Genomannotation und multiples Sequenzalignment.  Unsere bioinformatischen Werkzeuge beinhalten insbesondere das Genvorhersageprogramm AUGUSTUS und die BRAKER-Pipeline. Für Genvorheragedienste und mehr Informationen verweisen wir auf unseren Bioinformatik-Webserver.

Publikationen

Publikationsliste

Bachelor- und Masterthemen

Wenn Sie sich dafür interessieren, bei mir eine Bachelor- oder Masterarbeit zu schreiben, sprechen Sie mich einfach an oder schreiben eine kurze Mail.

Lehre

WS 2024/2025

  • Datenstrukturen und effiziente Algorithmen (4V+2Ü)
  • Genomanalyse (2V+2Ü)
  • Molekulare Evolution (?) (2V+2Ü)

SS 2024

  • Probabilistische Graphische Modelle (3V+1Ü)
  • Seminar Machine Learning in Bioinformatics (2S)
  • Bioinformatik (2V+2Ü)