Prof. Dr. Mario Stanke
Professur für Bioinformatik
Geschäftsführender Direktor des Insituts
Sprechstunde:
Dienstags, 11-12 Uhr, und nach Vereinbarung
Kontakt
Prof. Dr. Mario Stanke
Institut für Mathematik und Informatik
Walther-Rathenau-Straße 47
17489 Greifswald
Büro: Franz-Mehring-Straße 48
Telefon +49 3834 420 4642
Telefax +49 3834 420 4640
mario.stanke(at)uni-greifswald(dot)de
Anfahrt: Franz-Mehring-Straße 48
Forschungsinteressen
Meine Hauptforschungsinteressen sind probabilistische Modelle für strukturierte biologische Daten und effiziente Algorithmen für Inferenz in diesen Modellen. Insbesondere entwickeln, trainieren und implementieren wird bedingte Markow'sche Zufallsfelder für verschiedene konkrete Anwendungen wie Genomannotation, die Erkennung von Rekombination und Protein-Protein-Interfacevorhersage. Unsere bioinformatischen Werkzeuge beinhalten insbesondere das Genvorhersageprogramm AUGUSTUS und die BRAKER-Pipeline. Für Genvorheragedienste und mehr Informationen verweisen wir auf unseren Bioinformatik-Webserver.
Stellen
- 2 Doktorandenstellen (Genome als Graph repräsentieren, vergleichende Genomannotation)
Bachelor- und Masterthemen
Wenn Sie sich dafür interessieren, bei mir eine Bachelor- oder Masterarbeit zu schreiben, sprechen Sie mich einfach an oder schreiben eine kurze Mail.
Lehre
SS 2017
- Elternzeit
WS 2016/2017
- Datenbanken (2V+2Ü, zusammen mit Dr. Bulla/Gerischer)
- Genomanalyse (2V+2Ü)
- Datenstrukturen und effiziente Algorithmen (4V+2Ü)
SS 2016
- Maschinelles Lernen (2V+2Ü)
- Bioinformatisches Praktikum (2V+2Ü)